故事围绕着一群大学生展开。他们共同经历了丰富多彩的校园生活，一起参加运动会，为了班级荣誉奋力拼搏；在宿舍里彻夜长谈，分享彼此的梦想和烦恼。然而，大学并非只有欢乐。随着时间的推移，他们也面临着各种挑战和抉择。有人在学业压力下迷茫，有人在感情问题上困惑。但他们在彼此的支持下，逐渐成长，学会面对困难，勇敢地做出选择。最终，四年的大学生活结束，他们带着满满的回忆和对未来的期待，迈向新的人生阶段。
在人类与敌人——“Unknown”持续战争的世界。 数十年前“Unknown”侵略时被送往冷冻睡眠设施避难的孩子们，从沉睡中醒来之时，得知自己的身体中被发现了超自然的力量——“世界”。为了从出现在东京湾的“Unknown”手中保护国家，少年少女们在东京、神奈川、千叶的各防卫都市展开战斗。 东京由相乐总、神奈川由橘公司、千叶由渡航担当，创造出“QUALIDEA”的世界。 数十年前“Unknown”侵略时被送往冷冻睡眠设施避难的孩子们，现在终于从沉睡中醒来，而他们得到了新的力量“世界”，朱雀一弥和宇多良金丝雀也是其中之一。各都市的代表齐聚一堂，就在三都市例会结束后湾岸部Aqua Line南方海域确认了大规模的Unknown出现反应，东京、神奈川、千叶防卫都市三校立即展开迎击。 公主在消灭Unknown的时候失手摧毁了重要的设施，修缮aqua line的任务就落在了各都市的代表头上，朱雀等人靠着自己的力量加快了修缮的进度，刚刚修缮完毕aqua line，新的任务就出现了。青生的世界可以扫描他人的视觉、听觉及主观印象再重播给别人，朱雀等人从目击者的角度看到了海里疑似Unknown的存在，搜寻任务立即开始。Aqua line海萤前面海域出现了超巨大Unknown，这是比之前最大的特里同级还要大的新型，管理局将此新型暂称为利维坦级，明早在日出时分三校将同时前去讨伐，这是与此前截然不同的战斗。为了证明自己的朱雀提前赶赴现场，金丝雀发现后也前来支援，但此次敌人的能力完全超出了他们的想象。金丝雀的负伤让朱雀非常的内疚与自责，三校的代表全都聚集了过来，开始向利维坦级Unknown展开攻势，但即便是公主的全力一击也无法伤及它的一分一毫。恢复精神的朱雀立即组织人员开始反击，各地的战斗人员全都积极加入了战斗。从医院中醒来的金丝雀得知大家都在战斗后执意前往战场，她的歌声鼓舞了所有的人。
在冲绳合宿中，在由于朝阳的云隙光而达到了最高氛围值的桥上，雪村和冰室进行了理论值最高的亲吻，但由于采集的唾液量并不充足，于是决定再次测量。为拜访唾液检测的专家，一行人动身前往理工部生命科学学院。而他们面前出现的是花魁打扮配一袭白衣的艳丽女子翠雨，以及她的恋人克里斯。雪村邀请翠雨二人帮助他们一起完成「证明喜欢的实验」，却因此见识了翠雨他们压倒性的爱之气场……
侵略者ムゲ・ゾルバドス軍の攻撃により、地球は壊滅的な打撃を受けた。だが、ロス・イゴール長官と葉月博士が密かにイーグルファイターら4体の「獣戦機」を完成、藤原忍ら4人を召集し「獣戦機隊」を編成。これに対抗する。
